function onBeforeCompileHead() {
$document = JFactory::getDocument();
$document->_script = str_replace('jQuery(\'.hasTooltip\').tooltip({"html": true,"container": "body"});', '', $document->_script);
}

Или

JFactory::getDocument()->addScriptDeclaration('(function($){$.fn.tooltip=function(){}})(jQuery);');

Или

JHTML::_('bootstrap.tooltip');
$document = JFactory::getDocument();
$document->_script = str_replace("jQuery(document).ready(function(){\n\tjQuery('.hasTooltip').tooltip({\"html\": true,\"container\": \"body\"});\n});", '', $document->_script);